故事开篇，路上行人全被一只孔雀吸入腹中，吐出后皆是白骨。此时，远处一位身周万丈光芒的穹高正在和“水头像”奎刚进行对峙。原来奎刚竟然是穹高在修炼过程中的痛苦和仇恨，所幻化成的独自个体。代表黑暗的奎刚，在这场对峙中最终败给了代表光明的穹高，穹高也被太上老君推举为玉帝。然而此时，孔雀却将穹高和奎刚变成的黑莲一起吞入腹中。玉帝打败孔雀并为己所用，又恐奎刚所变成的黑莲会借着孔雀的力量重新幻化，决定请三界第一巧手阿依那伐将黑莲从孔雀腹中取出。但奎刚用变化骗过了阿依那伐，阿依那伐取出的黑莲并不是奎刚的元神黑莲。实际上奎刚早已提前幻化了。而从奎刚幻化的那一刻起，一场五百年后的浩劫就注定要产生。阿修罗界位于三界的缝隙之内，只有邪魔和恶灵才能够在这里生存。在这里，奎刚赐予众妖肉身，并有了自己的一众跟随者。奎刚为了获得肉身，需要在人间收集九百九十九个男人的阳气，九百九十九对童男童女的精血以及九百九十九个姹女的阴精。但由于阿修罗界的妖怪对人间并不熟悉，要想收集这些，需要获得重华宫中妖怪的帮助。

奎刚借助黑鸦大王的身体进入天界，并威逼利诱武德星君放上古巨怪蜃、九婴和巨蝎下界。奎刚故意制造天界混乱，声东击西，而武德星君趁奎刚与哪吒混战之时，放出古巨怪蜃、九婴和巨蝎。这个突袭者实力非凡，而且竟然会使用只有玉帝才会的五雷决法，令众人感到十分诧异。天界众人经过一番推测，断定其为奎刚，并判断重华宫逃走的蜃、九婴、巨蝎三怪也与奎刚有关。奎刚委蜃全权，九婴、巨蝎从旁辅佐。并遣蜃、九婴和巨蝎下界为妖，命他们抓捕阳男姹女及童婴，每样九百九十九之数，总共三千九百九十六人，而后送至阿修罗界。玉帝告诉众人，五百年后的劫数必然到来，然此厄很快可解，但必须找到一位三界大护法。该护法必须天生地长，肉身成圣，既不在天地海众神之列，更不是世间的凡人。玉帝命哪吒找到该位三界大护法，并传授他神功。哪吒查阅天籍，终找到了符合三界大护法条件的灵石--泰山玉皇顶的九灵石。同时玉帝也杨戬寻找蜃、九婴和巨蝎的下落，并将他们一网打荆同时，奎刚也获得了玉帝正在寻找护法大师--九灵石的消息。奎刚命令蜃、九婴和巨蝎到泰山玉皇顶找到九灵石，等其孕化成人形，立即除掉。

在晨曦微露之时，泰山玉皇顶的灵石--石敢当破石而出。此时哪吒发现了蜃、九婴和巨蝎。蜃谎称自己是泰山绝顶的九灵石，骗取了哪吒的信任，令哪吒收其为徒、并传授其神力。骗过了哪吒之后，蜃找到了九灵石。蜃、九婴和巨蝎三人合力试图杀害九灵石石敢当，没想到石敢当实力超群，在混战中，石敢当逃脱了。杨戬此时看到一股强劲的白光，断定是是下界的妖蜃、九婴和巨蝎所发出。但蜃认出了杨戬的身份，声称自己是三界护法九灵石，并称九婴和巨蝎是精凌松子和绿琮仙子。由于蜃拿出了哪吒给他的册子，杨戬相信了他们。此外，蜃还骗杨戬去找石敢当，想借助杨戬之力解决掉石敢当。此时，由于石敢当状似人形，然额头异象，胸前背后，覆盖晶石毛羽，和常人十分不同。因此在村落中被当成了妖怪。众村民一起冲上前来，棍棒齐下，石敢当挣扎着向村外奔去。在汴梁，石敢当饿极了，只好抓起摊上炸好的豆腐吃起来。没想到豆腐店老板上告公差，石敢当被当做妖怪抓了起来。董推官见石敢当长相奇异，为了讨好笃信神仙鬼道的圣上，决定将石敢当交予皇上。

术士告诉皇上，石敢当是天生地长的石精，最适合做长生不老药丸的引子。皇上虽有不忍，但念其并非人身，最终同意。术士在逼石敢当现行不成之后，决定将其塞入炼丹炉中，将其炼化。没想到石敢当在烈火炼化之下依然活着。最终术士决定将其脑袋砍下后，再将头颅、尸体放进丹炉中抟炼。然而在刽子手砍石敢当的头颅之际，石敢当发出的巨大冲击波竟将周围的卫士震飞、术士震死。并且与此同时，石敢当肋生双翅，飞起空中，不见了踪迹。在云雾山中，猎户兄妹朱半斤、朱玉莲发现了被烧得一动不动的石敢当。石敢当看到朱半斤和朱玉莲，十分惊恐，不敢与之交谈。朱半斤虽然不太情愿，但是由于朱玉莲的坚持，二人将石敢当带回家中收留他，并帮助石敢当治疗身上的烧伤。石敢当谈起从幻化成人到现在的经历泣不成声，对于兄妹二人的帮助行为非常感激。在兄妹家里，石敢当不仅能搬得动六七百斤的草垛，还能爬到绝壁顶端摘下千年灵芝。杨戬回忆起当时白光，认为当日泰山所见的那股原力之强远超过自己，开始怀疑是不是是不是蜃、九婴和巨蝎三怪的元神。

在首阳山上坐落着一座极为豪华的庄园。这位庄园一夜之间拔地而起，村民感到非常奇怪，猜测为神仙点化。众村民进入后却发现庄园突然消失，自己身处洞穴之中，想要逃跑却已经来不及。此时蜃、九婴、巨蝎三人所诱捕的阳男已有近百人了，但单凭这座首阳山庄想凑足这四千之数依然非常困难。蜃决定联络各路精怪前来助阵。石敢当、朱半斤、朱玉莲靠打柴小赚了一笔，想在布摊买些布做新衣服。此时，开封府的捕快头子的儿子想强抢玉莲，被朱半斤狠揍了一顿。过了一会，李衙内领着十几个打手冲上前来，朱半斤寡不敌众，朱玉莲也被抢走。而石敢当由于害怕，既没有帮助朱半斤，也没有保护好朱玉莲。入夜时分，朱半斤和石敢当前去李衙内家中营救玉莲。石敢当非常害怕，只能由朱半斤负责引开李衙内后，朱半斤再去救玉莲，待救出玉莲后再帮助朱半斤飞出高墙。救出玉莲后，石敢当为自己之前的行为感到很悔恨。认为兄妹二人对他那么好，他胆子却那么小，实在对不起玉莲。玉莲耐心安慰他，劝他不要做“东郭先生”。两人情愫暗生。李衙内打听到兄妹二人的住处，带领打手到兄妹二人家里绑走了朱玉莲。石敢当开始很害怕不敢出手，经过挣扎后终于出手打走了李衙内，救下了玉莲，并称不再做“东郭先生”。

蜃来到云雾山，找到豹子精帮助自己寻找姹女，并让他顺便除去石敢当。李衙内准备了各种祭品和各种金银珠宝，以求豹子精帮其杀死朱家两名男子(石敢当、朱半斤)，将朱玉莲交予自己。朱玉莲对石敢当已渐生爱意，而石敢当却浑然不知。此时，豹子精冲入朱家，石敢当向前扑去，朱家三人和众妖混战。豹子精将石敢当甩入了悬崖，并将朱家兄妹二人带回山洞。石敢当躺在谷底，伤口神奇地愈合了。他爬上悬崖，却发现朱家小院已经被烧为灰烬，他在大雨中伤心欲绝地奔跑。在悲痛中，他坠入山洞，却机缘巧合发现了石神剑和石神锤，并修习了《石神剑法》。在豹子精的洞穴中，豹子精想留下朱玉莲做压寨夫人，与李衙内发生了冲突。李衙内被豹子精杀死。石敢当冲到豹子精洞穴营救朱家兄妹二人，在这次与豹子精的打斗中，石敢当占了上风。豹子精假装求饶，实则趁机扭转局势杀死玉莲，并将剑刺入石敢当胸口。没想到石敢当头顶的泥丸宫打开，一束白光冲天而起，石像缓缓升起。而豹子精则被烈焰燃烧成灰烬。

石敢当头顶的白光救活了玉莲，被朱半斤认定为神仙。石敢当也通过这次事再次明白了不能当“东郭先生”的道理。随后顺着洞里的蓝光，三人发现了一柄发光的钉耙。石敢当打开钉耙顶部，里面的小珠子竟然自己飞入朱半斤口中。吃完小珠子后，朱半斤先变成猪八戒又变回自己的样子，还能拿得起来之前拿不动的钉耙。不仅如此，朱半斤还可以把这个钉耙使得虎虎生风。三人在回家途中遇到二郎神杨戬，杨戬认定石敢当和朱家兄妹是妖怪，要捉拿他们。在打斗过程中，杨戬发现朱家兄妹不是妖怪，但他依然深信不疑地认为石敢当是妖怪蜃。此时，石敢当的泥丸宫再次打开，石敢当和朱家兄妹得以逃脱。杨戬感受到了石敢当超强的原力，感到很吃惊。奎刚派黑袍护法到蜃处视察，得知只找到了八百余人。蜃说西海龙王敖闰之子敖申的姑父被天庭冤杀，可以利用他急于复仇的心理，让他在开封府的上空施‘龙困浅滩’之法，引发天灾后，恐吓城中的皇帝和百姓，逼她们交出阳男姹女和童婴。石敢当、朱家兄妹三人被小相国寺的住持慧清长老收留。石敢当因为当时面对杨戬选择逃跑，感到十分后悔沮丧。

天气突降大雨，玉莲在回家的路上竟然遇到一条巨龙横亘城中，慌忙跑回家去。皇宫内外，处处都人心惶惶。龙困浅滩，必然招致大雨不停，将城市淹没。石敢当想挺身而出解决问题，但朱家兄妹都不同意，认为太危险了。此时土地冒出，说只有石敢当，才能够收服这条孽龙。城中水患愈加严重，此时这个巨龙出现在天空并幻化为人形，让皇帝在十日之内，交出九百九十名阳男，九百九十九名姹女，九百九十九名童男，九百九十九名童女，总共是三千九百九十六之数。否则，他就杀光全城的人。石敢当感慨道，坏人之所以肆无忌惮地作恶就是因为好人太懦弱，他下定决心要去除恶龙。朱家兄妹拼命阻止，然而就算玉莲表露真心和爱意也没能改编石敢当的决定。最后石敢当和玉莲决定先向皇帝打听巨龙的出处。皇帝和大臣向上苍虔诚祷告，太上老君告诉他们只有石敢当才能拯惩凶靖难。侍卫开始穿街走巷地寻找石敢当。正在这时，石敢当也主动去皇宫询问情况，发现皇帝之前和巨龙并无冤仇，也不知巨龙的出处。这时土地出现，告诉石敢当巨龙敖申的地址在隐雾山中的角羽泽。石敢当来到角羽泽寻找敖申。而蜃得到敖申的消息，准备动身去都城接受三千九百九十六名阳男姹女和童婴。

石敢当、朱家兄妹三人谈话间，脚下土地飞快地动起来，发现自己原来站在巨龙敖申身上。敖申腾空而起，三人紧追不舍，敖申却已消失不见。三人判断，敖申是扎入了旁边的深潭。三人决定一起下去深潭寻找敖申。三人顺着水流向下潜去，穿过石壁，不远处出现了一个洞穴。内洞中倒悬瀑布，钻过瀑布，有一个巨大山洞。此时敖申出现了，在和敖申的战斗中，石敢当逐渐占了上风。但是没想到敖申从人体变成巨龙之身，口中喷出一连串的火球。石敢当被火球击中，掉入龙池。朱家兄妹拖起被火灼伤的石敢当向洞外奔去。树林深处，朱半斤和石敢当发生争执。朱半斤不赞同继续和敖申斗争，而石敢当则认为必须给老百姓个交代。在石敢当和玉莲的坚持下，朱半斤只得同意。石敢当决定再下深潭，一探究竟。石敢当躲在巨石后，偷听敖申和蜃谈话。听到敖申对蜃说，除非有人能摘了我顶上这颗龙珠，让他不能变成成龙，否则谁也打不过他。此时朱半斤和朱玉莲正在岸上焦急地等待。

几个人从杨戬的手下逃了出来，都觉得杨戬武功高强自己不是对手。途中几个人觉得情投意合，于是主动提出结拜为兄弟，石敢当为大哥，朱半斤为二哥，敖申是三弟，几人从此祸福与共，生死不离。敖申告诉石敢当昨天杨戬并没有痛下杀手，恐怕是误会石敢当是蜃了，以后石敢当还是和杨戬去一趟天庭证明自己身份的好。石敢当对于杨戬很不服气，就是不愿意听从杨戬的意思。蜃和九婴等三个妖怪躲藏在首阳山里面，为了防止被别人杀上门来，准备了几道厉害的武器。其中第一道叫做迷魂阵，招魂幡幻化成了一面巨大的镜子，人在镜子面前一照，镜子中就会幻化出一个和人一模一样的幻象用来攻击本人，要想破了这个迷魂阵只有打碎招魂幡。第一阵由九婴把守。第二阵叫做滚石红砂阵，其中有弱水、齿轮和巨斧，同时天上还会降下来剧毒的红砂，要想通过非常艰难。第二阵蜃安排了巨蝎把守。最后一关叫做大风阵，原来蜃找到了上古巨怪妖邪第一的后风，只要被他看上一眼，人就能变成蜡像。蜃收到了消息，得知敖申竟然被石敢当收服，带着他们来到了首阳山上。石敢当等人来到了山上，见到家家户户都挂孝很是惊异。几人来到了山村里面的一户人家中，主人好客的给他们送上了食物，告诉他们半年前首阳山上忽然出现了一座庄园，进入里面的人都被吸成了干尸，消失了几千几百人。村庄里面的人都认为有妖怪，不敢在山村里面呆下去，纷纷逃走了。蜃决定利用杨戬除去石敢当，骗杨戬说石敢当就是杨戬一直在寻找的蜃。一开始杨戬并不相信，但是随后听说蜃在首阳山中杀害了不少百姓，于是决定明天去首阳山上看看。与此同时，石敢当等人开始上山，进入了第一关迷魂阵中。

泰山老奶奶出现，在问过毒蜂怪所来目的后，用拂尘将毒蜂怪打的脑浆迸裂，然而没想到死去的毒蜂怪竟然从地上爬起身来，转了转脖子，又走到碧霞元君面前。碧霞元君逐渐体力不支，蜂王连放毒水、毒火，将碧霞元君逼得连连后退。就在危急关头，石敢当左翅猛力搧出，一阵石雨砸向毒蜂怪和群峰，毒蜂怪只得逃跑。泰山老奶奶道感念石兄拔刀相助，并询问了石敢当之所以借三叶隐形草的原因和经过后，把将三叶草给了石敢当，希望他能降妖除怪、救民水火。石敢当担心毒蜂怪不肯善罢甘休，决定先帮泰山老奶奶除去毒蜂怪。石敢当三人来到伏牛山，并找到了毒蜂怪的藏身之处。石敢当发现原来所谓的毒蜂怪的身体、头颅都是毒蜂组成的。因此，要想解决这个毒蜂怪，首先要解决毒蜂群。而将白木放在火里燃烧，便可以将毒虫、马蜂等毒物熏死。取来白木后，朱家兄妹在山坳中燃气烈火，石敢当则将毒蜂怪引到山坳处，看到飞来的群峰，朱家兄妹将白木投入烈火中。毒蜂群随后冲来，群峰不及刹车纷纷冲入火中。而毒蜂怪也在和石敢当的战斗中被闪电劈死。

泰山老奶奶知道石敢当杀死了毒蜂怪后，把隐形三叶草送给了石敢当。待石敢当回来之时，已是第十日清晨。正是皇帝与敖申约定交出三千九百九十六名阳男姹女和童婴之期。这时敖申已经向皇城方向飞去了。敖申冲入宫禁之中，连喷火焰，蜃、巨蝎等妖怪在旁给敖申助威叫好。皇帝无法，只好交出阳男姹女。敖申称，需明天清晨凑足剩余之数，否则全城老少玉石俱焚。这时石敢当正好赶到皇城。蜃和巨蝎认为敖申已经失去作用，不如让他杀死石敢当或者当替死鬼，因此离开留下了敖申一人。敖申与石敢当奋战，石敢当拿出隐形三叶草，趁敖申不备之时取走了他的龙珠。敖申的原身摔到洛河岸旁，在朱半斤举起铡刀正在杀他之际，敖申留下了眼泪。原来敖申想到姑父的血仇难报，不禁伤心落泪。石敢当听完敖申的故事，给了敖申帮助自己去蜃的老窝就两千多百姓的机会，来换取自己的性命。石敢当、敖申、朱家兄妹一同前去首阳山捉妖。在途中石敢当劝说敖申要有底线和原则，不要为非作歹。这时杨戬出现，让石敢当同他一起去天庭验明正身，证明自己不是蜃。石敢当拒绝后，石敢当四人和杨戬作战，然而杨戬实力超凡，为石敢当四人所不能及。在杨戬要杀死石敢当之际，石敢当四人争相赴死。杨戬望着眼前讲义气重感情的这些人，对他们是否是妖孽产生了怀疑。

朱半斤用生猪腿扔杨戬，使他们一行四人得以逃脱。途中，石敢当、朱半斤、敖申结拜为兄弟，石敢当为大哥、朱半斤为二哥、敖申为三哥，发誓患难与共，生死相扶。敖申说到石敢当应该和杨戬一起回天界、否则杨戬绝不会善罢甘休，石敢当说看不惯杨戬狂傲自大的样子。蜃、九婴和巨蝎为了防止身份败露，杨戬和石敢当前来找他们，设下了三道大阵。第一阵为迷魂阵。招魂幡幻化出无数镜子，人在镜子中看到的是自己，却与自己的动作完全不同。当进攻者准备自卫，或者与镜中人战斗之时，它又不知不觉地回到镜子当中，如果你将镜子砸碎，镜子转瞬之间就会复原。破解此阵的唯一方法就是打碎招魂幡。第二阵为滚石红纱阵。通过此阵需要先后通过弱水池、齿轮组、巨斧组，进攻者必须要跃过圆石，同时躲过天空降下的红纱，只要被红纱沾到、立刻就会化成脓水。第三阵则要面对上古巨怪后风，不管是谁，只要正眼看到后风，便会立刻变成石像。蜃听到石敢当已经进入首阳山中的消息后，决定利用二郎神将其彻底消灭。

石敢当四人来到村庄，看看家家挂孝十分奇怪。通过询问得知，首阳山上突然出现了一个非常豪华的山庄，村民出于好奇前去游玩，却只见去不见回，回来的两三个人也都面色极端恐惧。后来乡亲们赶才发现那些前去寻人的青壮年，都被厉鬼吸成了干尸。蜃骗杨戬石敢当就是蜃，而且也正在首阳山中，杨戬对于石敢当就是蜃这件事产生怀疑。石敢当一行人来到了庄子，庄子中万分惊险，先是万丈深渊、又是大片树林。之后竟然又遇到了杨戬，杨戬将石敢当、玉莲、朱半斤和敖申都吸进了布袋之中。蜃建议杨戬将石敢当一行人当场杀死被杨戬拒绝了。石敢当一行人醒来后，却发现自己在群山之中。在群山之中有一户人家，石敢当向主人借宿却被拒绝。玉莲终于表露了心意，石敢当表示只要玉莲不嫌弃他是石头变的、他就愿意娶她为妻。正说话间，十几个强盗沿着飞奔上岭，要杀了该户人家的主人刘猎户。没想到石敢当以德报怨，救下了刘猎户一家。石敢当四人继续前行，遇到一座很窄的石拱桥，桥面勉强能够容纳一人通过。而一位老翁横坐在对面的桥口处，正好堵住了桥口。原来这位老翁的鞋子掉到了瀑布中，是想让人把他掉下山的鞋捡回来。当石敢当帮老翁把鞋子捡回时，老翁又得寸进尺地要求石敢当帮他穿上鞋子，石敢当也照做了。最后石敢当又按照老翁的要求把他背过了桥。

蜃一行人正在商量如何把四千人转运至阿修罗界时，小妖报告石敢当回来了。由于只有石敢当一人回来，蜃推测是石敢当从杨戬那里逃了出来。却没想到这个石敢当是杨戬幻化形成的。杨戬假装石敢当，诱使蜃将自己的身份来历目的等统统说了出来。三怪连忙逃进了首阳山庄，开启了三阵。杨戬识破了第一阵，打碎了招魂幡破解了此阵。石敢当四人途中经过了一家道观，却没想到道观殿中央堆放着金银财宝、珍珠玛瑙，旁边还有两具尸体。朱半斤想要将这些财宝贪下，被石敢当制止。石敢当劝朱半斤说，君子爱财取之有道，不要太贪。不仅如此，石敢当还决定将这些财宝埋入地下，以免后来人看到这些财宝引起杀戮。谁知此时，殿中忽然传来一声巨响，霎时间道观、财宝、尸体竟都不见了踪迹。他们惊奇地发现，自己竟然置身在一艘飞行的天舰上。原来石敢当等人这一路上遇到的种种怪事，都是杨戬在试探他们。杨戬承认石敢当并非蜃。而且能够完美通过试探的，除了玉帝和太上老君，石敢当还是第一人。因此杨戬断定石敢当就是玉帝寻找的三界大护法--泰山石圣。

这次二郎神率领一众天神，连同石敢当四人，一起来到首阳山庄。没想到由于之前蜃诬告了石敢当等人，蜃又使用诡计让自己的真身看起来是块石头，因此哪吒坚持不相信石敢当是好人。此时杨戬告诉哪吒，石敢当通过了上神试探的事实，让哪吒左右为难。说到情急处，石敢当和哪吒打了起来，各自的天兵也都打得不可开交，一片混乱。这时石敢当站了出来，问到：“既然要说要消灭我们，为什么最后非但不敢迎战，还要把三太子搬来做护身符”时，哪吒无言以对。石敢当提议有事情由石敢当和蜃自行解决，便是由石敢当率弟兄们前去攻打首阳三阵，而对方则只有石九灵三人可以应战。石敢当等人拜杨戬为师，杨戬将法力传给了这四人。此外杨戬还赠予了他们一面可令时空停滞，百毒不侵的杏黄旗。面对第一阵迷魂阵，石敢当用杏黄旗保护好朱半斤、朱玉莲和敖申，自己则用掌心雷击碎了招魂幡。守阵的九婴出现后，他们几人合力打败了九婴，并且石敢当用石神锤封住了他的泥丸宫，使九婴再也无法变化。

面对第二阵，石敢当、敖申、朱玉莲三人都跳上悬石通过了弱水池，只有朱半斤犹豫懦弱，不敢上前，最后险些丧命。在接下来的齿轮组、巨斧组中，朱玉莲和朱半斤借助杏黄旗顺利通过，石敢当和敖申也通过了这两阵。然后朱半斤得意地举起杏黄旗拉着玉莲，向滚石红纱阵跑去。没想到他们俩人却被红纱围了起来。石敢当只得求助杨戬，杨戬告诉石敢当要想破解此阵，需要隐身三叶草、盘古开天钺和三头雷看守的天镜盾。而杏黄旗也只能支撑两天，因此他们也只有两天的时间来获取盘古开天钺和天镜盾。哪吒回想起和杨戬、蜃的对话，心中泛起怀疑。他化身为蜜蜂，飞到了主洞墙壁之上。此时，蜃正在和黑袍护法汇报说，杨戬识破了他的身份，而由于其在阿修罗界的‘化妖作坊’内呆了一天，照妖镜也无法看出破绽，哪吒则敌我不辨，不但收了他做徒弟，还将神功和枪法传授于他。此时哪吒才彻底明白，他变成真身和黑袍护法、蜃等人打了起来，但是哪吒寡不敌众，被关押了起来。蜃算出石敢当前去昆仑山寻找宝物，决定立刻出发，赶赴昆仑，截杀石敢当。

石敢当和敖申在昆仑山中救下了一只被蜘蛛精抓捕的小鹿。这只小鹿已经修炼千年，可以变成人形，名叫鹿儿。鹿儿引他们去了陆吾洞。只见一只一人高的人形蝙蝠倒挂在溶洞之中。石敢当将蝙蝠杀死后，蝙蝠变成了一把金钥匙。山洞的尽头，巨石呈长方形紧贴石壁而立，中央有一块凹槽。将金钥匙贴上石上凹槽后，盘古开天钺迎光而出。当石敢当和敖申出洞后，鹿儿已经不在那里。这时蜃突然现身，双方混站起来。石敢当击中了蜃，蜃起火燃烧。但是转眼间蜃就不见了踪影，原来蜃将衣服点化成自己的模样来迷惑人，本人却逃走了。这时，石敢当和敖申听到了鹿儿呼叫的声音，匆匆赶去。石敢当救下鹿儿，问鹿儿是否听说过轩辕洞，鹿儿表示没听说过。石敢当决定先在鹿儿的家中休息一晚，明早再去打听。鹿儿拿出人参汤来招待石敢当和敖申，没想到这人参汤中被下了毒，而鹿儿则是由蜃伪装而成。却原来这一切都是石敢当的伪装，石敢当是为了要从蜃口中得知鹿儿的下落，才假装自己中计。石敢当和蜃打了起来，但蜃再次用幻术逃脱。石敢当也通过之前蜃所说的地址，救下了被绑在树林里的小鹿。

鹿儿告诉他们，想要盗取天镜盾，绝不能惊动三头雷。只用隐形三叶草的话虽然能够隐遁身形，却无法隐去身上的气味。但只要三头雷吃了人参，就可以怀揣人参从他身边走过，他就是闻到了也以为是自己身上的味道。石敢当按计行事，成功进入轩辕洞内。但没想到，天镜盾外有个大水罩。石敢当使用盘古开山钺砸开了水罩，获取了天镜盾，却吵醒了三头雷。幸亏情急之中鹿儿提醒他们使用三叶草，使他们成功逃脱。蜃手下的小妖几乎全军覆没。在他焦急之时，得到了黑袍护法显化正率领阿修罗界众妖前往首阳山庄驰援的消息。石敢当攻进红纱阵，使用盘古开山钺和天镜盾成功救出了朱半斤和朱玉莲，并且毁了这红纱阵，让它不再害人。之后石敢当几人又合力打败了巨蝎。第三关大风阵，大风阵中藏着一个上古巨怪，名叫后风。无论是谁，只要与看到了他的眼睛，立时变为石像。石敢当让众人背靠石壁站好，听到风声立刻闭眼。石敢当单枪匹马挑战后风，刺中了风后。然而这时蜃趁石敢当不备，偷偷从洞口进入，恰好被玉莲看见。蜃幻化成风后，而真正的风后则趁石敢当不注意和他四目相对。在这千钧一发之际，玉莲叫住了石敢当，和风后的视线对上，成了石像。

玉帝得知了石敢当粉碎奎刚的阴谋，并攻破首阳三阵，杀死毒龙妖蜃，将九婴、巨蝎擒拿回天的消息，十分欣慰。决定赐朱玉莲神号为玉莲圣母，并宣见石敢当等人。黑袍护法、赢妖等人看着一片寂静的大风阵，将蜃的遗体所化之沙土吸入葫芦。奎刚称他们还有一个机会，就是取得镇妖石。石敢当、敖申、朱半斤三人穿过云梦台，登上天舰向对面驶去。朱半斤下天舰之后看到自己的尸体浮在空中，才知自己已经脱离肉体得道成仙。夜里，石敢当看到窗外闪过一道蓝光，而那蓝光消失之处望去，竟然是中进接引天尊的居所。石敢当将花架变成自己的样子，自己则变成小蜜蜂的样子向接引天尊的住所飞去。只见接引和黑衣人正密谋石敢当觐见和镇妖石的事情。待黑衣人离开后，石敢当幻化成黑衣人的样子揭穿了接引，接引选择自戕，肉身化作石像沙尘。